Występuje zwykle w ciągu 24-48 h od operacji i jest spowodowana niedokrwieniem śluzówki jelita lub ściany jelita. Początkowo stomia staje się ciemnoczerwona a potem czarna, co jest efektem niewłaściwego przepływu krwi. Jeśli martwica dotyczy niewielkiego obszaru stomii zwykle usuwa się martwe części stomii. W wypadku gdy martwica obejmie całą stomię poniżej otrzewnej konieczna jest ponowna operacja.